Sammy de schildpad is terug! Alhoewel het dit keer niet zozeer om Sammy zelf draait, maar meer om de schattige kleine schildpadjes Ricky en Ella. Al aan het begin van de film wordt hun opa Sammy gevangen genomen samen met zijn goede vriend Ray. De twee oude schildpadden worden ontvoerd naar een aquarium in Dubai, waar zij aan toeristen tentoongesteld worden. De jonge schildpadjes gaan op pad om Sammy en Ray te vinden en te bevrijden.

Natuurlijk komen Ricky en Ella op hun speurtocht allerlei nieuwe vrienden tegen, zoals vissen, zeepaardjes, inktvissen, pinguïns, zeemeeuwen en kreeften. Intussen leren Sammy en Ray in het aquarium ook nieuwe zeedieren kennen, zoals zeepaardje Big D en de grappige bolle blobvis Jimbo. Wanneer Ricky en Ella erachter komen waar Sammy en Ray verblijven, verzinnen zij een list om de oude schildpadden te helpen ontsnappen. Daarbij zullen zij wel de hulp nodig hebben van al hun nieuwe vriendjes die ze onderweg hebben leren kennen.

Net als de eerste film van Sammy bevat ook dit tweede avontuur de nodige humor en spanning, terwijl de jonge kijkertjes tegelijk ook nog een hoop opsteken over wat voor levensvormen er zoal in onze oceanen leven.